Pemeriksaan dengan sampel sputum, pus, swab mata, swab hidung, swab tenggorokan, swab uretra, swab serviks, swab telinga, bilasan bronkus dan dilakukan pembiakkan di suatu media, lalu setelah terjadi pertumbuhan mikroorganisme dilakukan identifikasi jenisnya. Jenis sampel cairan tubuh yang diperlukan tergantung dari penyakit yang akan di diagnosis.